Сектори

1. Сектор за електроенергетика
   • Одделение за правни и економски работи во областа на елекртоенергетиката
   • Одделение за електроенергетика и технички работи
   • Одделение за проекти, производство, снабдување и пазар со електрична енергија
   • Одделение за проекти, пренос и дистрибуција на електрична енергија
2. Сектор за обновливи извори на енергија
   • Одделение за планирање и развој на енергетиката во областа на обновливи извори на енергија
   • Одделение за проекти во областа на обновливи извори на енергијата
   • Одделение за унапредување на капацитетите во областа на обновливите извори на енергија
   • Одделение за правни и управни работи во областа на обновливите извори на енергија
3. Сектор за енергетска ефикасност и климатски промени
   • Одделение за енергетска ефикасност
   • Одделение за унапредување на енергетската ефикасност во секторот на потрошувачка на енергија
   • Одделение за енергетски менаџмент
   • Одделение за унапредување на енергетската ефикасност во секторите на производство на енергија и висока ефикасна когенерација
   • Одделение за одржлив развој и климатските промени во енергетиката
4. Сектор за нафта и гас
   • Одделение за техничко- технолошки работи во областа на нафтата и гасот
   • Одделение за нафта и гас
   • Одделение за опрема под притисок
   • Одделение за правни и управни работи во областа на нафтата и гасот
   • Одделение за економски работи и следење на состојбата во областа на нафтата и гасот
5. Сектор за геологија и рударство
   • Одделение за геолошки истражувања и рударство
   • Одделение за геолошки истражувања на минералните суровини
   • Одделение за подземни води, геотермални ресурси и геолошки истражувања
   • Одделение за рударство
   • Одделение за рударски отпад, санација и рекултивација на рудниците
   • Одделение за правни и економски работи во областа на геологијата и рударството
6. Сектор за меѓународна соработка и ЕУ интеграција
   • Одделение за меѓународна соработка
   • Одделение за ЕУ интеграција
   • Одделение за управување со проектите
   • Одделение за планирање и програмирање на проектите
   • Одделение за спроведување и следење на проектите
7. Сектор за општи, правни работи и административни работи
   • Одделение Кабинет на министерот
   • Одделение за општи работи
   • Одделение за правни работи
8. Сектор за финансиски прашања
   • Одделение за буџетска координација
   • Одделение за буџетска контрола
   • Одделение за сметководство и плаќања
9. Сектор за јавни набавки
   • Одделение за подготовка и поддршка на јавни набавки
   • Одделение за реализација на постапки за јавни набавки
10. Секторот за информатички технологии и телекомуникации
    • Одделение за системска администрација и заштита
    • Одделение за деловни системи
11. Сектор за управување со човечки ресурси
    • Одделение за персонална евиденција и персонални работи
    • Одделение за спроведување на постапките за управување со човечките ресурси

Во министерството за енергетика, рударство и минерални суровини функционираат и три органи:

• Биро за метрологија
• Државен инспекторат за техничка инспекција
• Геолошки завод