Sektorët

1. Departamenti i Energjisë Elektrike
   • Departamenti për Çështje Ligjore dhe Ekonomike në Fushën e Energjisë Elektrike
   • Departamenti i Energjisë Elektrike dhe Çështjeve Teknike
   • Departamenti për Projekte, Prodhim, Furnizim dhe Treg të Energjisë Elektrike
   • Departamenti për Projekte, Transmetim dhe Shpërndarje të Energjisë Elektrike
2. Sektori i Energjisë së Rinovueshme
   • Departamenti për Planifikim dhe Zhvillim të Energjisë në Fushën e Burimeve të Energjisë së Rinovueshme
   • Departamenti për projekte në fushën e burimeve të energjisë së rinovueshme
   • Departamenti për Zhvillimin e Kapaciteteve në Fushën e Burimeve të Energjisë së Rinovueshme
   • Departamenti për Çështje Ligjore dhe Administrative në Fushën e Burimeve të Energjisë së Rinovueshme
3. Sektori për Efiçiencën e Energjisë dhe Ndryshimet Klimatike
   • Departamenti i Efiçiencës së Energjisë
   • Departamenti për Promovimin e Efiçiencës së Energjisë në Sektorin e Konsumit të Energjisë
   • Departamenti i Menaxhimit të Energjisë
   • Departamenti për Promovimin e Efiçiencës së Energjisë në Sektorët e Prodhimit të Energjisë dhe Kogjenerimit me Efiçiencë të Lartë
   • Departamenti për Zhvillim të Qëndrueshëm dhe Ndryshime Klimatike në Energji
4. Sektori i Naftës dhe Gazit
   • Departamenti për Çështje Teknike dhe Teknologjike në Fushën e Naftës dhe Gazit
   • Departamenti i Naftës dhe Gazit
   • Departamenti i Pajisjeve nën Presion
   • Departamenti për Çështje Ligjore dhe Administrative në Fushën e Naftës dhe Gazit
   • Departamenti për Çështjet Ekonomike dhe Monitorimin e Situatës në Fushën e Naftës dhe Gazit
5. Departamenti i Gjeologjisë dhe Minierave
   • Departamenti i Eksplorimit Gjeologjik dhe Minierave
   • Departamenti për Eksplorimin Gjeologjik të Burimeve Minerale
   • Departamenti i Ujërave Nëntokësore, Burimeve Gjeotermale dhe Eksplorimit Gjeologjik
   • Departamenti i Minierave
   • Departamenti për Mbetjet e Minierave, Rehabilitimin dhe Bonifikimin e Minierave
   • Departamenti për Çështje Ligjore dhe Ekonomike në Fushën e Gjeologjisë dhe Minierave
6. Sektori për Bashkëpunim Ndërkombëtar dhe Integrim në BE
   • Departamenti për Bashkëpunim Ndërkombëtar
   • Departamenti për Integrimin në BE
   • Departamenti i Menaxhimit të Projekteve
   • Departamenti i Planifikimit dhe Programimit të Projekteve
   • Departamenti i Zbatimit dhe Monitorimit të Projekteve
7. Sektori për Çështje të Përgjithshme, Ligjore dhe Administrative
   • Departamenti i Zyrës së Ministrit
   • Departamenti i Çështjeve të Përgjithshme
   • Departamenti i Çështjeve Ligjore
8. Departamenti i Çështjeve Financiare
   • Departamenti i Koordinimit të Buxhetit
   • Departamenti i Kontrollit Buxhetor
   • Departamenti i Kontabilitetit dhe Pagesave
9. Sektori i Prokurimit Publik
   • Departamenti për Përgatitjen dhe Mbështetjen e Prokurimit Publik
   • Departamenti për zbatimin e procedurave të prokurimit publik
10. Sektori i Teknologjisë së Informacionit dhe Telekomunikacionit
    • Departamenti i Administrimit dhe Mbrojtjes së Sistemit
    • Departamenti i Sistemeve të Biznesit
11. Departamenti i Menaxhimit të Burimeve Njerëzore
    • Departamenti për të Dhënat e Personelit dhe Çështjet e Personelit
    • Departamenti për zbatimin e procedurave të menaxhimit të burimeve njerëzore

Në kuadër të Ministrisë së Energjisë, Minierave dhe Burimeve Minerale veprojnë edhe tre organe:

• Byroja e Metrologjisë
• Inspektorati Shtetëror për Inspektimin Teknik
• Instituti Gjeologjik